Hiện trạng trường THPT Yên Hòa chưa có hệ thống xử lý nước, nước thải trong sinh hoạt và học tập thải trực tiếp ra sông Tô Lịch lâu ngày tích tụ lại thành bùn cống rãnh với mùi hôi thối nồng nặc kèm theo đó là hàm lượng độc chất chưa được xử lí. Ô nhiễm từ nước thải sinh hoạt và những thí nghiệm học tập: có mùi hôi và bệnh tật đang là vấn đề nhức nhối, ô nhiễm môi trường nước, ô nhiễm môi trường đất và ô nhiễm môi trường không khí với tác hại khó lường